ES多索引同时查询很慢

3台物理机器节点，索引使用的默认5个shard。起初只有一个索引，存储两个月的数据，数据量大概10亿.做聚合查询时间要几十秒，甚至分钟级的响应。
然后我按月拆分成两个索引，使用Java API查询时，我需要查询两个月的数据，setIndices(index1,index2)同时查询两个索引，无论是聚合还是条件查询都慢的要死，单索引查询速度有了很大提升。
疑问：按理来说，索引拆分后查询应该会变快，出现这种变慢的情况搞不懂是什么原因。
  是因为两个索引数据量都比较大么？还是因为ES多个索引同时查询就是很慢？
  哪位大神也有这种同时查询多个索引的情况，能指点下么？